آموزش نصب بایوپایتون

آموزش نصب بایوپایتون

در این درس از آموزش های برنامه نویسی سایت سورس باران، آموزش نصب بایوپایتون بر روی دستگاه شما توضیح داده شده است. نصب آن بسیار آسان است و پنج دقیقه بیشتر طول نمی کشد.

پیشنهاد ویژه : پکیج آموزش پروژه محور پایتون

مرحله ۱ – تأیید نصب پایتون

بایوپایتون برای کار با نسخه های پایتون ۲٫۵ یا بالاتر طراحی شده است. بنابراین  اجباری است که ابتدا پایتون نصب شود. دستور زیر را در خط فرمان خود اجرا کنید –

> python --version

در زیر تعریف شده است –

در صورت نصب صحیح، نسخه پایتون را نشان می دهد. در غیر این صورت، آخرین نسخه پایتون را دانلود کنید، آن را نصب کنید و دوباره دستور را اجرا کنید.

مرحله ۲ – نصب Biopython با استفاده از pip

نصب بایوپایتون با استفاده از pip از خط فرمان در همه سیستم عامل ها آسان است. دستور زیر را تایپ کنید:

> pip install biopython

پاسخ زیر روی صفحه شما مشاهده می شود –

برای به روزرسانی نسخه قدیمی بایوپایتون:

> pip install biopython –-upgrade

پاسخ زیر روی صفحه شما مشاهده می شود –

پس از اجرای این دستور، قبل از نصب نسخه های اخیر، نسخه های قدیمی  NumPy و Biopython حذف می شوند.

مرحله ۳ – تأیید نصب بایوپایتون

اکنون، شما با موفقیت بایوپایتون را بر روی دستگاه خود نصب کرده اید. برای تأیید اینکه Biopython به درستی نصب شده است ، دستور زیر را روی کنسول python خود تایپ کنید –

این نسخه بایوپایتون را نشان می دهد.

روش جایگزین – نصب بایوپایتون با استفاده از Source

• برای نصب بایوپایتون با استفاده از سورس کد، دستورالعمل های زیر را دنبال کنید:
• نسخه اخیر بایوپایتون را از لینک زیر دانلود کنید – https://biopython.org/wiki/Download
• هم اکنون، آخرین نسخه biopython-1.72 است.
• فایل را دانلود کرده و فایل بایگانی فشرده شده را باز کنید، به پوشه سورس کد بروید و دستور زیر را تایپ کنید:

> python setup.py build

این بایوپایتون را از سورس کد به شرح زیر می سازد –

اکنون، کد را با استفاده از دستور زیر آزمایش کنید:

> python setup.py test

در آخر، با استفاده از دستور زیر نصب را تکمیل کنید:

> python setup.py install

منبع.

لیست جلسات قبل آموزش برنامه نویسی بایوپایتون

1. آموزش برنامه نویسی بایوپایتون (Biopython)
2. معرفی برنامه نویسی بایوپایتون